Protein–RNA interactions for Protein: P20352

F3, Tissue factor, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F3P20352 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
F3P20352 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
F3P20352 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
F3P20352 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
F3P20352 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
F3P20352 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
F3P20352 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
F3P20352 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
F3P20352 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
F3P20352 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
F3P20352 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
F3P20352 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
F3P20352 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
F3P20352 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
F3P20352 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
F3P20352 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
F3P20352 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
F3P20352 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
F3P20352 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
F3P20352 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
F3P20352 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
F3P20352 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
F3P20352 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
F3P20352 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
F3P20352 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
F3P20352 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
F3P20352 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
F3P20352 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
F3P20352 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
F3P20352 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
F3P20352 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
F3P20352 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
F3P20352 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
F3P20352 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
F3P20352 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
F3P20352 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
F3P20352 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
F3P20352 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
F3P20352 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
F3P20352 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
F3P20352 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
F3P20352 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
F3P20352 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
F3P20352 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
F3P20352 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
F3P20352 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
F3P20352 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
F3P20352 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
F3P20352 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
F3P20352 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
F3P20352 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
F3P20352 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
F3P20352 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
F3P20352 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
F3P20352 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
F3P20352 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
F3P20352 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
F3P20352 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
F3P20352 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
F3P20352 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
F3P20352 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
F3P20352 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
F3P20352 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
F3P20352 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
F3P20352 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
F3P20352 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
F3P20352 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
F3P20352 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
F3P20352 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
F3P20352 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
F3P20352 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
F3P20352 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
F3P20352 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
F3P20352 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
F3P20352 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
F3P20352 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
F3P20352 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
F3P20352 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
F3P20352 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
F3P20352 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
F3P20352 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
F3P20352 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
F3P20352 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
F3P20352 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
F3P20352 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
F3P20352 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
F3P20352 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
F3P20352 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
F3P20352 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
F3P20352 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
F3P20352 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
F3P20352 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
F3P20352 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
F3P20352 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
F3P20352 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
F3P20352 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
F3P20352 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
F3P20352 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
F3P20352 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
F3P20352 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms