Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pou5f1P20263 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pou5f1P20263 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms