Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ms4a1P19437 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ms4a1P19437 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms