Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tnnc1P19123 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tnnc1P19123 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms