Protein–RNA interactions for Protein: P17679

Gata1, Erythroid transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata1P17679 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gata1P17679 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gata1P17679 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gata1P17679 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gata1P17679 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gata1P17679 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gata1P17679 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gata1P17679 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gata1P17679 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gata1P17679 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gata1P17679 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms