Protein–RNA interactions for Protein: P16305

Gabra6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra6P16305 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gabra6P16305 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gabra6P16305 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gabra6P16305 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gabra6P16305 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gabra6P16305 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gabra6P16305 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gabra6P16305 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gabra6P16305 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gabra6P16305 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gabra6P16305 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gabra6P16305 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gabra6P16305 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gabra6P16305 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gabra6P16305 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gabra6P16305 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gabra6P16305 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gabra6P16305 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gabra6P16305 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gabra6P16305 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gabra6P16305 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gabra6P16305 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gabra6P16305 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gabra6P16305 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gabra6P16305 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gabra6P16305 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gabra6P16305 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gabra6P16305 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gabra6P16305 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gabra6P16305 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gabra6P16305 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gabra6P16305 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gabra6P16305 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gabra6P16305 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gabra6P16305 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gabra6P16305 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gabra6P16305 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gabra6P16305 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gabra6P16305 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gabra6P16305 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gabra6P16305 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gabra6P16305 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gabra6P16305 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gabra6P16305 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gabra6P16305 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gabra6P16305 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gabra6P16305 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gabra6P16305 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gabra6P16305 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gabra6P16305 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gabra6P16305 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gabra6P16305 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gabra6P16305 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gabra6P16305 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gabra6P16305 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gabra6P16305 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gabra6P16305 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gabra6P16305 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gabra6P16305 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gabra6P16305 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gabra6P16305 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gabra6P16305 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gabra6P16305 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gabra6P16305 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gabra6P16305 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gabra6P16305 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gabra6P16305 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gabra6P16305 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gabra6P16305 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gabra6P16305 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gabra6P16305 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gabra6P16305 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gabra6P16305 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gabra6P16305 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gabra6P16305 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gabra6P16305 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gabra6P16305 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gabra6P16305 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gabra6P16305 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gabra6P16305 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gabra6P16305 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gabra6P16305 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gabra6P16305 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gabra6P16305 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gabra6P16305 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gabra6P16305 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gabra6P16305 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gabra6P16305 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gabra6P16305 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gabra6P16305 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gabra6P16305 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gabra6P16305 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gabra6P16305 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gabra6P16305 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gabra6P16305 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gabra6P16305 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gabra6P16305 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gabra6P16305 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gabra6P16305 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gabra6P16305 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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