Protein–RNA interactions for Protein: P15975

Usp53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp53P15975 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp53P15975 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp53P15975 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp53P15975 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp53P15975 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp53P15975 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Usp53P15975 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp53P15975 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp53P15975 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp53P15975 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp53P15975 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp53P15975 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp53P15975 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp53P15975 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp53P15975 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp53P15975 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp53P15975 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp53P15975 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp53P15975 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp53P15975 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp53P15975 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp53P15975 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp53P15975 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Usp53P15975 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp53P15975 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp53P15975 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp53P15975 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp53P15975 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp53P15975 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp53P15975 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp53P15975 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp53P15975 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp53P15975 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp53P15975 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp53P15975 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp53P15975 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp53P15975 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp53P15975 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp53P15975 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp53P15975 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp53P15975 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp53P15975 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp53P15975 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp53P15975 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp53P15975 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp53P15975 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp53P15975 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp53P15975 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp53P15975 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp53P15975 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp53P15975 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp53P15975 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp53P15975 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp53P15975 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp53P15975 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp53P15975 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp53P15975 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp53P15975 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp53P15975 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp53P15975 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp53P15975 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp53P15975 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp53P15975 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp53P15975 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp53P15975 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp53P15975 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp53P15975 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp53P15975 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp53P15975 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp53P15975 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp53P15975 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp53P15975 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp53P15975 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp53P15975 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp53P15975 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp53P15975 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp53P15975 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp53P15975 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp53P15975 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp53P15975 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp53P15975 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp53P15975 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp53P15975 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp53P15975 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp53P15975 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp53P15975 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp53P15975 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp53P15975 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp53P15975 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp53P15975 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp53P15975 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp53P15975 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp53P15975 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp53P15975 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp53P15975 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp53P15975 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms