Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P10404 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P10404 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P10404 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P10404 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P10404 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P10404 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P10404 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P10404 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P10404 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P10404 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
P10404 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P10404 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P10404 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P10404 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P10404 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P10404 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P10404 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P10404 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P10404 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P10404 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
P10404 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P10404 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P10404 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P10404 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P10404 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P10404 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P10404 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P10404 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P10404 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P10404 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P10404 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P10404 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P10404 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P10404 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P10404 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P10404 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P10404 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P10404 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P10404 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P10404 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P10404 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P10404 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P10404 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P10404 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P10404 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P10404 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P10404 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P10404 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P10404 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P10404 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P10404 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P10404 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P10404 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P10404 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P10404 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P10404 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P10404 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P10404 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P10404 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P10404 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P10404 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P10404 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P10404 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P10404 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P10404 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P10404 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
P10404 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P10404 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P10404 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P10404 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P10404 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P10404 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P10404 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P10404 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P10404 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P10404 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P10404 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P10404 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P10404 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P10404 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P10404 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P10404 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P10404 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P10404 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P10404 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P10404 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P10404 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P10404 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P10404 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P10404 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P10404 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P10404 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P10404 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P10404 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P10404 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P10404 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P10404 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P10404 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P10404 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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