Protein–RNA interactions for Protein: P0DOY1

Dnmt3c, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3C, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3cP0DOY1 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dnmt3cP0DOY1 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnmt3cP0DOY1 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnmt3cP0DOY1 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnmt3cP0DOY1 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnmt3cP0DOY1 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnmt3cP0DOY1 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnmt3cP0DOY1 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnmt3cP0DOY1 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnmt3cP0DOY1 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnmt3cP0DOY1 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnmt3cP0DOY1 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnmt3cP0DOY1 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dnmt3cP0DOY1 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms