Protein–RNA interactions for Protein: P09632

Hoxb8, Homeobox protein Hox-B8, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb8P09632 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb8P09632 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb8P09632 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb8P09632 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb8P09632 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb8P09632 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb8P09632 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb8P09632 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb8P09632 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb8P09632 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb8P09632 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb8P09632 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb8P09632 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb8P09632 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb8P09632 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb8P09632 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb8P09632 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb8P09632 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb8P09632 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb8P09632 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb8P09632 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb8P09632 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb8P09632 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb8P09632 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb8P09632 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb8P09632 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb8P09632 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb8P09632 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb8P09632 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb8P09632 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb8P09632 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb8P09632 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb8P09632 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb8P09632 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb8P09632 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb8P09632 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb8P09632 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb8P09632 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb8P09632 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb8P09632 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb8P09632 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb8P09632 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb8P09632 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb8P09632 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb8P09632 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb8P09632 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb8P09632 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb8P09632 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb8P09632 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb8P09632 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb8P09632 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb8P09632 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb8P09632 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb8P09632 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb8P09632 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb8P09632 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb8P09632 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb8P09632 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb8P09632 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb8P09632 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb8P09632 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb8P09632 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb8P09632 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb8P09632 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb8P09632 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb8P09632 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb8P09632 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb8P09632 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb8P09632 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb8P09632 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb8P09632 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb8P09632 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb8P09632 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb8P09632 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb8P09632 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb8P09632 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb8P09632 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb8P09632 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb8P09632 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb8P09632 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb8P09632 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb8P09632 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb8P09632 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxb8P09632 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxb8P09632 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxb8P09632 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxb8P09632 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxb8P09632 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxb8P09632 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxb8P09632 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxb8P09632 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxb8P09632 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxb8P09632 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxb8P09632 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxb8P09632 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxb8P09632 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxb8P09632 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxb8P09632 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxb8P09632 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxb8P09632 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms