Protein–RNA interactions for Protein: P01644

Ig kappa chain V-V region HP R16.7, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01644 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01644 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01644 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01644 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01644 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
P01644 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01644 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
P01644 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01644 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01644 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01644 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01644 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01644 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01644 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01644 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01644 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01644 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01644 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01644 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01644 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01644 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01644 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01644 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
P01644 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
P01644 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01644 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01644 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01644 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01644 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01644 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01644 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
P01644 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01644 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01644 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01644 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01644 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01644 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01644 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01644 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01644 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01644 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01644 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01644 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01644 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01644 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01644 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01644 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01644 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01644 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01644 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01644 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
P01644 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01644 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01644 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01644 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01644 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01644 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01644 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01644 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01644 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01644 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01644 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01644 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01644 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01644 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01644 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01644 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01644 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01644 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01644 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01644 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01644 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01644 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01644 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01644 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01644 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01644 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01644 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01644 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
P01644 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01644 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01644 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
P01644 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
P01644 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01644 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01644 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01644 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01644 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01644 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01644 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
P01644 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01644 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01644 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01644 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01644 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01644 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01644 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
P01644 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01644 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01644 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms