Protein–RNA interactions for Protein: O88958

Gnpda1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnpda1O88958 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gnpda1O88958 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gnpda1O88958 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gnpda1O88958 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gnpda1O88958 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gnpda1O88958 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gnpda1O88958 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gnpda1O88958 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gnpda1O88958 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gnpda1O88958 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gnpda1O88958 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gnpda1O88958 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gnpda1O88958 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gnpda1O88958 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gnpda1O88958 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gnpda1O88958 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gnpda1O88958 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gnpda1O88958 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gnpda1O88958 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gnpda1O88958 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gnpda1O88958 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gnpda1O88958 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gnpda1O88958 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gnpda1O88958 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gnpda1O88958 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gnpda1O88958 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gnpda1O88958 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gnpda1O88958 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gnpda1O88958 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gnpda1O88958 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gnpda1O88958 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gnpda1O88958 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gnpda1O88958 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gnpda1O88958 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gnpda1O88958 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gnpda1O88958 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gnpda1O88958 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gnpda1O88958 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gnpda1O88958 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gnpda1O88958 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gnpda1O88958 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gnpda1O88958 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gnpda1O88958 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gnpda1O88958 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gnpda1O88958 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gnpda1O88958 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gnpda1O88958 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gnpda1O88958 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gnpda1O88958 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gnpda1O88958 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gnpda1O88958 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gnpda1O88958 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gnpda1O88958 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gnpda1O88958 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gnpda1O88958 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gnpda1O88958 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gnpda1O88958 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gnpda1O88958 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gnpda1O88958 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gnpda1O88958 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gnpda1O88958 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gnpda1O88958 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gnpda1O88958 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gnpda1O88958 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gnpda1O88958 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gnpda1O88958 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gnpda1O88958 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gnpda1O88958 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gnpda1O88958 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gnpda1O88958 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gnpda1O88958 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gnpda1O88958 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gnpda1O88958 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gnpda1O88958 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gnpda1O88958 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gnpda1O88958 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gnpda1O88958 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gnpda1O88958 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gnpda1O88958 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gnpda1O88958 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gnpda1O88958 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gnpda1O88958 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gnpda1O88958 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gnpda1O88958 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gnpda1O88958 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gnpda1O88958 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gnpda1O88958 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gnpda1O88958 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gnpda1O88958 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gnpda1O88958 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gnpda1O88958 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gnpda1O88958 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gnpda1O88958 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gnpda1O88958 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gnpda1O88958 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gnpda1O88958 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gnpda1O88958 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gnpda1O88958 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gnpda1O88958 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gnpda1O88958 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms