Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Hcn2O88703 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hcn2O88703 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hcn2O88703 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hcn2O88703 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hcn2O88703 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hcn2O88703 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hcn2O88703 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Hcn2O88703 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hcn2O88703 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hcn2O88703 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Hcn2O88703 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hcn2O88703 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Hcn2O88703 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hcn2O88703 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hcn2O88703 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hcn2O88703 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hcn2O88703 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hcn2O88703 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hcn2O88703 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hcn2O88703 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hcn2O88703 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hcn2O88703 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Hcn2O88703 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hcn2O88703 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hcn2O88703 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Hcn2O88703 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hcn2O88703 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hcn2O88703 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hcn2O88703 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hcn2O88703 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hcn2O88703 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hcn2O88703 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hcn2O88703 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hcn2O88703 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hcn2O88703 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hcn2O88703 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hcn2O88703 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hcn2O88703 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hcn2O88703 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hcn2O88703 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Hcn2O88703 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hcn2O88703 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Hcn2O88703 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Hcn2O88703 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Hcn2O88703 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hcn2O88703 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hcn2O88703 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hcn2O88703 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hcn2O88703 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hcn2O88703 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hcn2O88703 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hcn2O88703 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hcn2O88703 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hcn2O88703 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hcn2O88703 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Hcn2O88703 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hcn2O88703 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hcn2O88703 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hcn2O88703 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hcn2O88703 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hcn2O88703 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hcn2O88703 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hcn2O88703 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Hcn2O88703 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hcn2O88703 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hcn2O88703 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hcn2O88703 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hcn2O88703 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hcn2O88703 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hcn2O88703 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hcn2O88703 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hcn2O88703 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hcn2O88703 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hcn2O88703 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hcn2O88703 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hcn2O88703 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hcn2O88703 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Hcn2O88703 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms