Protein–RNA interactions for Protein: O70492

Snx3, Sorting nexin-3, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx3O70492 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Snx3O70492 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Snx3O70492 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx3O70492 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Snx3O70492 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx3O70492 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx3O70492 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Snx3O70492 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx3O70492 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx3O70492 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Snx3O70492 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx3O70492 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Snx3O70492 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Snx3O70492 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx3O70492 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Snx3O70492 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Snx3O70492 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx3O70492 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx3O70492 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx3O70492 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx3O70492 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx3O70492 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx3O70492 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx3O70492 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx3O70492 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx3O70492 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Snx3O70492 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx3O70492 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx3O70492 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx3O70492 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx3O70492 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Snx3O70492 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx3O70492 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx3O70492 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx3O70492 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx3O70492 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx3O70492 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx3O70492 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Snx3O70492 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx3O70492 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx3O70492 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx3O70492 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx3O70492 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Snx3O70492 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx3O70492 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx3O70492 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx3O70492 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx3O70492 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx3O70492 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx3O70492 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx3O70492 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx3O70492 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx3O70492 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx3O70492 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx3O70492 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx3O70492 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx3O70492 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx3O70492 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx3O70492 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx3O70492 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx3O70492 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx3O70492 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx3O70492 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx3O70492 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx3O70492 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx3O70492 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx3O70492 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Snx3O70492 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Snx3O70492 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snx3O70492 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Snx3O70492 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snx3O70492 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snx3O70492 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Snx3O70492 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Snx3O70492 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Snx3O70492 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Snx3O70492 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx3O70492 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx3O70492 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Snx3O70492 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Snx3O70492 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx3O70492 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx3O70492 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx3O70492 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx3O70492 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx3O70492 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx3O70492 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx3O70492 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx3O70492 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx3O70492 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx3O70492 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx3O70492 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx3O70492 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Snx3O70492 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx3O70492 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Snx3O70492 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Snx3O70492 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx3O70492 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx3O70492 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Snx3O70492 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms