Protein–RNA interactions for Protein: O70309

Itgb5, Integrin beta-5, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb5O70309 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Itgb5O70309 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Itgb5O70309 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms