Protein–RNA interactions for Protein: O70174

Chrna4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna4O70174 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Chrna4O70174 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Chrna4O70174 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms