Protein–RNA interactions for Protein: O55236

Rngtt, mRNA-capping enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RngttO55236 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RngttO55236 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RngttO55236 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RngttO55236 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RngttO55236 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RngttO55236 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RngttO55236 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RngttO55236 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RngttO55236 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RngttO55236 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RngttO55236 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RngttO55236 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RngttO55236 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RngttO55236 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RngttO55236 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RngttO55236 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RngttO55236 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RngttO55236 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RngttO55236 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RngttO55236 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RngttO55236 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RngttO55236 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RngttO55236 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
RngttO55236 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RngttO55236 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RngttO55236 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RngttO55236 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RngttO55236 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
RngttO55236 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
RngttO55236 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RngttO55236 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RngttO55236 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RngttO55236 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RngttO55236 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RngttO55236 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RngttO55236 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RngttO55236 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RngttO55236 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RngttO55236 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RngttO55236 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RngttO55236 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RngttO55236 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RngttO55236 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RngttO55236 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RngttO55236 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RngttO55236 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RngttO55236 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RngttO55236 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RngttO55236 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RngttO55236 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RngttO55236 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RngttO55236 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RngttO55236 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RngttO55236 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RngttO55236 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RngttO55236 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RngttO55236 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RngttO55236 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RngttO55236 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RngttO55236 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RngttO55236 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RngttO55236 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RngttO55236 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RngttO55236 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RngttO55236 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RngttO55236 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RngttO55236 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RngttO55236 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RngttO55236 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RngttO55236 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RngttO55236 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RngttO55236 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RngttO55236 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RngttO55236 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RngttO55236 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RngttO55236 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RngttO55236 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RngttO55236 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RngttO55236 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RngttO55236 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RngttO55236 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RngttO55236 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RngttO55236 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RngttO55236 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RngttO55236 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RngttO55236 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RngttO55236 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RngttO55236 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RngttO55236 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RngttO55236 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RngttO55236 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RngttO55236 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RngttO55236 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RngttO55236 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RngttO55236 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RngttO55236 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RngttO55236 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RngttO55236 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RngttO55236 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RngttO55236 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms