Protein–RNA interactions for Protein: O55142

Rpl35a, 60S ribosomal protein L35a, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35aO55142 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl35aO55142 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Rpl35aO55142 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl35aO55142 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl35aO55142 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl35aO55142 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl35aO55142 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl35aO55142 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl35aO55142 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl35aO55142 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl35aO55142 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl35aO55142 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl35aO55142 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl35aO55142 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl35aO55142 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl35aO55142 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl35aO55142 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl35aO55142 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl35aO55142 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl35aO55142 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl35aO55142 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl35aO55142 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl35aO55142 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl35aO55142 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl35aO55142 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl35aO55142 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl35aO55142 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl35aO55142 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl35aO55142 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl35aO55142 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl35aO55142 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl35aO55142 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl35aO55142 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl35aO55142 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl35aO55142 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl35aO55142 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl35aO55142 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl35aO55142 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl35aO55142 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl35aO55142 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl35aO55142 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl35aO55142 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl35aO55142 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl35aO55142 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl35aO55142 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl35aO55142 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl35aO55142 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl35aO55142 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl35aO55142 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl35aO55142 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl35aO55142 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl35aO55142 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Rpl35aO55142 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rpl35aO55142 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rpl35aO55142 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rpl35aO55142 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rpl35aO55142 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rpl35aO55142 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rpl35aO55142 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rpl35aO55142 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rpl35aO55142 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rpl35aO55142 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Rpl35aO55142 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rpl35aO55142 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rpl35aO55142 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rpl35aO55142 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rpl35aO55142 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Rpl35aO55142 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Rpl35aO55142 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rpl35aO55142 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Rpl35aO55142 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Rpl35aO55142 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms