Protein–RNA interactions for Protein: O54909

Rdh16, Cis-retinol androgen dehydrogenase 1, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16O54909 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rdh16O54909 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rdh16O54909 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rdh16O54909 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Rdh16O54909 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rdh16O54909 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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Rdh16O54909 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Rdh16O54909 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Rdh16O54909 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Rdh16O54909 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rdh16O54909 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms