Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdc4O35988 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdc4O35988 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdc4O35988 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdc4O35988 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdc4O35988 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdc4O35988 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdc4O35988 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdc4O35988 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdc4O35988 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdc4O35988 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdc4O35988 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdc4O35988 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdc4O35988 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdc4O35988 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdc4O35988 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdc4O35988 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdc4O35988 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdc4O35988 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdc4O35988 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sdc4O35988 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sdc4O35988 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sdc4O35988 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sdc4O35988 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sdc4O35988 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sdc4O35988 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sdc4O35988 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sdc4O35988 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Sdc4O35988 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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