Protein–RNA interactions for Protein: O35904

Pik3cd, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3cdO35904 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pik3cdO35904 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pik3cdO35904 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pik3cdO35904 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pik3cdO35904 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pik3cdO35904 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pik3cdO35904 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pik3cdO35904 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pik3cdO35904 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pik3cdO35904 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pik3cdO35904 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pik3cdO35904 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pik3cdO35904 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pik3cdO35904 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pik3cdO35904 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pik3cdO35904 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pik3cdO35904 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pik3cdO35904 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pik3cdO35904 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pik3cdO35904 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pik3cdO35904 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pik3cdO35904 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pik3cdO35904 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pik3cdO35904 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pik3cdO35904 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pik3cdO35904 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pik3cdO35904 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pik3cdO35904 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pik3cdO35904 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pik3cdO35904 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pik3cdO35904 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pik3cdO35904 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pik3cdO35904 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pik3cdO35904 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pik3cdO35904 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pik3cdO35904 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pik3cdO35904 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pik3cdO35904 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pik3cdO35904 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pik3cdO35904 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pik3cdO35904 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pik3cdO35904 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pik3cdO35904 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pik3cdO35904 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pik3cdO35904 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pik3cdO35904 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pik3cdO35904 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pik3cdO35904 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pik3cdO35904 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pik3cdO35904 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pik3cdO35904 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pik3cdO35904 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pik3cdO35904 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pik3cdO35904 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pik3cdO35904 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pik3cdO35904 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pik3cdO35904 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pik3cdO35904 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pik3cdO35904 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pik3cdO35904 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pik3cdO35904 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pik3cdO35904 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pik3cdO35904 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pik3cdO35904 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pik3cdO35904 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pik3cdO35904 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pik3cdO35904 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pik3cdO35904 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pik3cdO35904 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pik3cdO35904 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pik3cdO35904 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pik3cdO35904 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pik3cdO35904 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pik3cdO35904 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pik3cdO35904 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pik3cdO35904 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pik3cdO35904 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pik3cdO35904 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pik3cdO35904 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pik3cdO35904 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pik3cdO35904 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pik3cdO35904 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pik3cdO35904 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pik3cdO35904 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pik3cdO35904 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pik3cdO35904 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pik3cdO35904 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pik3cdO35904 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pik3cdO35904 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pik3cdO35904 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pik3cdO35904 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pik3cdO35904 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pik3cdO35904 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pik3cdO35904 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pik3cdO35904 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pik3cdO35904 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pik3cdO35904 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pik3cdO35904 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pik3cdO35904 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pik3cdO35904 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms