Protein–RNA interactions for Protein: O35602

Rax, Retinal homeobox protein Rx, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RaxO35602 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RaxO35602 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RaxO35602 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RaxO35602 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RaxO35602 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RaxO35602 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RaxO35602 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RaxO35602 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RaxO35602 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RaxO35602 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RaxO35602 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RaxO35602 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RaxO35602 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RaxO35602 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RaxO35602 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RaxO35602 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RaxO35602 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RaxO35602 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RaxO35602 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RaxO35602 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RaxO35602 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RaxO35602 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RaxO35602 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RaxO35602 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RaxO35602 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RaxO35602 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RaxO35602 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RaxO35602 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RaxO35602 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RaxO35602 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RaxO35602 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RaxO35602 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RaxO35602 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RaxO35602 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RaxO35602 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RaxO35602 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RaxO35602 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RaxO35602 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RaxO35602 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RaxO35602 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RaxO35602 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RaxO35602 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RaxO35602 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RaxO35602 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RaxO35602 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RaxO35602 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RaxO35602 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RaxO35602 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RaxO35602 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RaxO35602 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RaxO35602 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RaxO35602 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RaxO35602 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RaxO35602 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RaxO35602 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RaxO35602 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RaxO35602 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RaxO35602 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RaxO35602 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RaxO35602 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RaxO35602 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RaxO35602 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RaxO35602 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RaxO35602 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RaxO35602 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RaxO35602 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RaxO35602 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RaxO35602 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RaxO35602 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RaxO35602 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RaxO35602 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RaxO35602 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RaxO35602 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RaxO35602 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RaxO35602 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RaxO35602 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RaxO35602 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RaxO35602 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RaxO35602 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RaxO35602 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RaxO35602 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RaxO35602 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RaxO35602 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RaxO35602 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RaxO35602 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RaxO35602 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RaxO35602 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RaxO35602 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RaxO35602 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RaxO35602 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RaxO35602 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RaxO35602 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RaxO35602 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RaxO35602 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RaxO35602 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RaxO35602 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RaxO35602 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RaxO35602 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RaxO35602 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RaxO35602 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms