Protein–RNA interactions for Protein: O35493

Clk4, Dual specificity protein kinase CLK4, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk4O35493 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clk4O35493 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clk4O35493 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clk4O35493 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clk4O35493 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
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Clk4O35493 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clk4O35493 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clk4O35493 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clk4O35493 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Clk4O35493 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clk4O35493 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clk4O35493 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Clk4O35493 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
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