Protein–RNA interactions for Protein: O35326

Srsf5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf5O35326 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Srsf5O35326 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms