Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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Scarb2O35114 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Scarb2O35114 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms