Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ArxO35085 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ArxO35085 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ArxO35085 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ArxO35085 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ArxO35085 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ArxO35085 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ArxO35085 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ArxO35085 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ArxO35085 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ArxO35085 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ArxO35085 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ArxO35085 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ArxO35085 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ArxO35085 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ArxO35085 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ArxO35085 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ArxO35085 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ArxO35085 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ArxO35085 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ArxO35085 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ArxO35085 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ArxO35085 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ArxO35085 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ArxO35085 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ArxO35085 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ArxO35085 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ArxO35085 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ArxO35085 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ArxO35085 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ArxO35085 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ArxO35085 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ArxO35085 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ArxO35085 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ArxO35085 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ArxO35085 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ArxO35085 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ArxO35085 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ArxO35085 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ArxO35085 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ArxO35085 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ArxO35085 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ArxO35085 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ArxO35085 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ArxO35085 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ArxO35085 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ArxO35085 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ArxO35085 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ArxO35085 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ArxO35085 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ArxO35085 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ArxO35085 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ArxO35085 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ArxO35085 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ArxO35085 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ArxO35085 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ArxO35085 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ArxO35085 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ArxO35085 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ArxO35085 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ArxO35085 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ArxO35085 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ArxO35085 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ArxO35085 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ArxO35085 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ArxO35085 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ArxO35085 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ArxO35085 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ArxO35085 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ArxO35085 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ArxO35085 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ArxO35085 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ArxO35085 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ArxO35085 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ArxO35085 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ArxO35085 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ArxO35085 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ArxO35085 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ArxO35085 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ArxO35085 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ArxO35085 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ArxO35085 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ArxO35085 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ArxO35085 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ArxO35085 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ArxO35085 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ArxO35085 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ArxO35085 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ArxO35085 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ArxO35085 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ArxO35085 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ArxO35085 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ArxO35085 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ArxO35085 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ArxO35085 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ArxO35085 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ArxO35085 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ArxO35085 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ArxO35085 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ArxO35085 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms