Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec22bO08547 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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