Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC3

BC024978, cDNA sequence BC024978, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC024978J3QPC3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC024978J3QPC3 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC024978J3QPC3 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
BC024978J3QPC3 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC024978J3QPC3 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC024978J3QPC3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
BC024978J3QPC3 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC024978J3QPC3 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC024978J3QPC3 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC024978J3QPC3 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC024978J3QPC3 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC024978J3QPC3 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC024978J3QPC3 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC024978J3QPC3 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BC024978J3QPC3 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC024978J3QPC3 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC024978J3QPC3 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BC024978J3QPC3 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BC024978J3QPC3 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
BC024978J3QPC3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC024978J3QPC3 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC024978J3QPC3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC024978J3QPC3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC024978J3QPC3 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC024978J3QPC3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC024978J3QPC3 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC024978J3QPC3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC024978J3QPC3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
BC024978J3QPC3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BC024978J3QPC3 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BC024978J3QPC3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BC024978J3QPC3 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BC024978J3QPC3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BC024978J3QPC3 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BC024978J3QPC3 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BC024978J3QPC3 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BC024978J3QPC3 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BC024978J3QPC3 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BC024978J3QPC3 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BC024978J3QPC3 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BC024978J3QPC3 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BC024978J3QPC3 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BC024978J3QPC3 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BC024978J3QPC3 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BC024978J3QPC3 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BC024978J3QPC3 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BC024978J3QPC3 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BC024978J3QPC3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BC024978J3QPC3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BC024978J3QPC3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BC024978J3QPC3 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BC024978J3QPC3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BC024978J3QPC3 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BC024978J3QPC3 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BC024978J3QPC3 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BC024978J3QPC3 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BC024978J3QPC3 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BC024978J3QPC3 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC024978J3QPC3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC024978J3QPC3 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC024978J3QPC3 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC024978J3QPC3 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC024978J3QPC3 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC024978J3QPC3 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC024978J3QPC3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC024978J3QPC3 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC024978J3QPC3 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC024978J3QPC3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC024978J3QPC3 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC024978J3QPC3 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC024978J3QPC3 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BC024978J3QPC3 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC024978J3QPC3 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC024978J3QPC3 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC024978J3QPC3 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC024978J3QPC3 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC024978J3QPC3 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BC024978J3QPC3 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC024978J3QPC3 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BC024978J3QPC3 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BC024978J3QPC3 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BC024978J3QPC3 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC024978J3QPC3 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC024978J3QPC3 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC024978J3QPC3 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC024978J3QPC3 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC024978J3QPC3 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC024978J3QPC3 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC024978J3QPC3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC024978J3QPC3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC024978J3QPC3 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC024978J3QPC3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC024978J3QPC3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC024978J3QPC3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC024978J3QPC3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BC024978J3QPC3 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BC024978J3QPC3 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BC024978J3QPC3 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BC024978J3QPC3 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
BC024978J3QPC3 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms