Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Smim18J3QNP2 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Smim18J3QNP2 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms