Protein–RNA interactions for Protein: J3QNF7

Gm17577, Predicted gene, 17467, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17577J3QNF7 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm17577J3QNF7 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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