Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS7

Gm11236, Predicted gene 11236, mousemouse

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11236J3QMS7 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
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Gm11236J3QMS7 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm11236J3QMS7 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Gm11236J3QMS7 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm11236J3QMS7 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm11236J3QMS7 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm11236J3QMS7 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm11236J3QMS7 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm11236J3QMS7 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm11236J3QMS7 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
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Gm11236J3QMS7 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm11236J3QMS7 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm11236J3QMS7 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Gm11236J3QMS7 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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