Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm3336J3QMQ6 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3336J3QMQ6 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3336J3QMQ6 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3336J3QMQ6 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3336J3QMQ6 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3336J3QMQ6 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3336J3QMQ6 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm3336J3QMQ6 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3336J3QMQ6 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3336J3QMQ6 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm3336J3QMQ6 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
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