Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn20G5E8X0 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms