Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Y1

Trim55, MCG19772, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim55G3X8Y1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Trim55G3X8Y1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms