Protein–RNA interactions for Protein: G3UW56

Vmn2r85, MCG21565, mousemouse

Predictions only

Length 850 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r85G3UW56 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r85G3UW56 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r85G3UW56 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r85G3UW56 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r85G3UW56 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r85G3UW56 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r85G3UW56 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r85G3UW56 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r85G3UW56 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r85G3UW56 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r85G3UW56 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vmn2r85G3UW56 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r85G3UW56 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r85G3UW56 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r85G3UW56 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r85G3UW56 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r85G3UW56 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r85G3UW56 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r85G3UW56 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r85G3UW56 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r85G3UW56 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r85G3UW56 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r85G3UW56 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r85G3UW56 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r85G3UW56 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r85G3UW56 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r85G3UW56 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r85G3UW56 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r85G3UW56 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r85G3UW56 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r85G3UW56 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r85G3UW56 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r85G3UW56 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r85G3UW56 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r85G3UW56 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r85G3UW56 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r85G3UW56 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r85G3UW56 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r85G3UW56 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r85G3UW56 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r85G3UW56 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vmn2r85G3UW56 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r85G3UW56 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r85G3UW56 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r85G3UW56 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r85G3UW56 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r85G3UW56 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r85G3UW56 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r85G3UW56 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r85G3UW56 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r85G3UW56 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r85G3UW56 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r85G3UW56 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r85G3UW56 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r85G3UW56 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r85G3UW56 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r85G3UW56 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r85G3UW56 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r85G3UW56 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r85G3UW56 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r85G3UW56 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r85G3UW56 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r85G3UW56 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r85G3UW56 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r85G3UW56 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r85G3UW56 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r85G3UW56 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r85G3UW56 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r85G3UW56 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r85G3UW56 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r85G3UW56 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r85G3UW56 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vmn2r85G3UW56 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r85G3UW56 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r85G3UW56 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r85G3UW56 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r85G3UW56 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r85G3UW56 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r85G3UW56 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r85G3UW56 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r85G3UW56 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r85G3UW56 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r85G3UW56 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r85G3UW56 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r85G3UW56 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r85G3UW56 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r85G3UW56 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r85G3UW56 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r85G3UW56 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r85G3UW56 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r85G3UW56 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r85G3UW56 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r85G3UW56 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r85G3UW56 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r85G3UW56 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r85G3UW56 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r85G3UW56 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r85G3UW56 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r85G3UW56 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Vmn2r85G3UW56 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms