Protein–RNA interactions for Protein: F8VQB8

Npcd, Neuronal pentraxin chromo domain, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NpcdF8VQB8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NpcdF8VQB8 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NpcdF8VQB8 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NpcdF8VQB8 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NpcdF8VQB8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NpcdF8VQB8 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NpcdF8VQB8 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NpcdF8VQB8 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NpcdF8VQB8 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NpcdF8VQB8 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NpcdF8VQB8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NpcdF8VQB8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NpcdF8VQB8 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NpcdF8VQB8 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NpcdF8VQB8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NpcdF8VQB8 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NpcdF8VQB8 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NpcdF8VQB8 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NpcdF8VQB8 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NpcdF8VQB8 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NpcdF8VQB8 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NpcdF8VQB8 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NpcdF8VQB8 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NpcdF8VQB8 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NpcdF8VQB8 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NpcdF8VQB8 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NpcdF8VQB8 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NpcdF8VQB8 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NpcdF8VQB8 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NpcdF8VQB8 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NpcdF8VQB8 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NpcdF8VQB8 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NpcdF8VQB8 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NpcdF8VQB8 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NpcdF8VQB8 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NpcdF8VQB8 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NpcdF8VQB8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NpcdF8VQB8 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NpcdF8VQB8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NpcdF8VQB8 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NpcdF8VQB8 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NpcdF8VQB8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NpcdF8VQB8 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NpcdF8VQB8 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NpcdF8VQB8 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NpcdF8VQB8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NpcdF8VQB8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NpcdF8VQB8 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NpcdF8VQB8 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NpcdF8VQB8 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NpcdF8VQB8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NpcdF8VQB8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NpcdF8VQB8 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NpcdF8VQB8 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NpcdF8VQB8 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NpcdF8VQB8 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NpcdF8VQB8 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NpcdF8VQB8 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NpcdF8VQB8 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NpcdF8VQB8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NpcdF8VQB8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NpcdF8VQB8 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NpcdF8VQB8 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NpcdF8VQB8 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NpcdF8VQB8 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NpcdF8VQB8 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NpcdF8VQB8 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NpcdF8VQB8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NpcdF8VQB8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NpcdF8VQB8 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NpcdF8VQB8 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NpcdF8VQB8 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NpcdF8VQB8 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NpcdF8VQB8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NpcdF8VQB8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NpcdF8VQB8 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NpcdF8VQB8 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NpcdF8VQB8 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NpcdF8VQB8 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NpcdF8VQB8 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NpcdF8VQB8 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NpcdF8VQB8 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NpcdF8VQB8 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NpcdF8VQB8 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NpcdF8VQB8 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NpcdF8VQB8 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NpcdF8VQB8 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NpcdF8VQB8 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NpcdF8VQB8 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NpcdF8VQB8 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NpcdF8VQB8 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NpcdF8VQB8 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NpcdF8VQB8 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NpcdF8VQB8 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NpcdF8VQB8 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NpcdF8VQB8 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NpcdF8VQB8 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NpcdF8VQB8 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NpcdF8VQB8 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NpcdF8VQB8 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.4 ms