Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ercc6F8VPZ5 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ercc6F8VPZ5 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ercc6F8VPZ5 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ercc6F8VPZ5 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ercc6F8VPZ5 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Ercc6F8VPZ5 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Ercc6F8VPZ5 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Ercc6F8VPZ5 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Ercc6F8VPZ5 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ercc6F8VPZ5 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ercc6F8VPZ5 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ercc6F8VPZ5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ercc6F8VPZ5 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ercc6F8VPZ5 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ercc6F8VPZ5 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ercc6F8VPZ5 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ercc6F8VPZ5 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ercc6F8VPZ5 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ercc6F8VPZ5 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ercc6F8VPZ5 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ercc6F8VPZ5 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ercc6F8VPZ5 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ercc6F8VPZ5 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ercc6F8VPZ5 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ercc6F8VPZ5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ercc6F8VPZ5 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ercc6F8VPZ5 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms