Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Farp1F8VPU2 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Gm12962-202ENSMUST00000144212 691 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Farp1F8VPU2 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms