Protein–RNA interactions for Protein: F8VPN3

Gm5160, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5160F8VPN3 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5160F8VPN3 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5160F8VPN3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5160F8VPN3 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5160F8VPN3 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5160F8VPN3 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5160F8VPN3 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5160F8VPN3 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5160F8VPN3 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5160F8VPN3 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5160F8VPN3 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5160F8VPN3 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5160F8VPN3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5160F8VPN3 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5160F8VPN3 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5160F8VPN3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5160F8VPN3 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5160F8VPN3 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5160F8VPN3 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5160F8VPN3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm5160F8VPN3 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5160F8VPN3 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5160F8VPN3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5160F8VPN3 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5160F8VPN3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5160F8VPN3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5160F8VPN3 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5160F8VPN3 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5160F8VPN3 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5160F8VPN3 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5160F8VPN3 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5160F8VPN3 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5160F8VPN3 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5160F8VPN3 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5160F8VPN3 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5160F8VPN3 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5160F8VPN3 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5160F8VPN3 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5160F8VPN3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5160F8VPN3 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5160F8VPN3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5160F8VPN3 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5160F8VPN3 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5160F8VPN3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5160F8VPN3 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5160F8VPN3 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5160F8VPN3 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5160F8VPN3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5160F8VPN3 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5160F8VPN3 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5160F8VPN3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm5160F8VPN3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm5160F8VPN3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm5160F8VPN3 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm5160F8VPN3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm5160F8VPN3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm5160F8VPN3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm5160F8VPN3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms