Protein–RNA interactions for Protein: F6XS56

Gm8444, Predicted gene 8444, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8444F6XS56 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8444F6XS56 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8444F6XS56 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8444F6XS56 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8444F6XS56 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8444F6XS56 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8444F6XS56 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8444F6XS56 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8444F6XS56 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8444F6XS56 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8444F6XS56 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8444F6XS56 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8444F6XS56 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8444F6XS56 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8444F6XS56 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8444F6XS56 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8444F6XS56 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8444F6XS56 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8444F6XS56 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8444F6XS56 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8444F6XS56 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8444F6XS56 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8444F6XS56 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8444F6XS56 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8444F6XS56 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8444F6XS56 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8444F6XS56 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8444F6XS56 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8444F6XS56 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8444F6XS56 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8444F6XS56 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8444F6XS56 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8444F6XS56 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8444F6XS56 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8444F6XS56 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8444F6XS56 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8444F6XS56 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm8444F6XS56 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8444F6XS56 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8444F6XS56 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8444F6XS56 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8444F6XS56 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8444F6XS56 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8444F6XS56 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8444F6XS56 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8444F6XS56 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8444F6XS56 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8444F6XS56 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8444F6XS56 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8444F6XS56 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8444F6XS56 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8444F6XS56 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8444F6XS56 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8444F6XS56 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8444F6XS56 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8444F6XS56 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm8444F6XS56 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8444F6XS56 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8444F6XS56 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8444F6XS56 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8444F6XS56 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8444F6XS56 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8444F6XS56 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8444F6XS56 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8444F6XS56 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8444F6XS56 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8444F6XS56 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8444F6XS56 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8444F6XS56 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8444F6XS56 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8444F6XS56 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8444F6XS56 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8444F6XS56 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8444F6XS56 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8444F6XS56 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8444F6XS56 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8444F6XS56 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8444F6XS56 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8444F6XS56 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm8444F6XS56 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms