Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Gm5861F6VCN9 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Gm5861F6VCN9 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm5861F6VCN9 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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