Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Syngap1F6SEU4 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Syngap1F6SEU4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms