Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9P8

Rdh16f1, RDH16 family member 1, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f1E9Q9P8 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rdh16f1E9Q9P8 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rdh16f1E9Q9P8 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rdh16f1E9Q9P8 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Rdh16f1E9Q9P8 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Rdh16f1E9Q9P8 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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Rdh16f1E9Q9P8 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Rdh16f1E9Q9P8 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Rdh16f1E9Q9P8 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdh16f1E9Q9P8 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Rdh16f1E9Q9P8 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Rdh16f1E9Q9P8 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdh16f1E9Q9P8 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
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Rdh16f1E9Q9P8 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Rdh16f1E9Q9P8 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
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Rdh16f1E9Q9P8 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
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