Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TrdnE9Q9K5 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TrdnE9Q9K5 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TrdnE9Q9K5 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TrdnE9Q9K5 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TrdnE9Q9K5 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
TrdnE9Q9K5 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TrdnE9Q9K5 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TrdnE9Q9K5 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TrdnE9Q9K5 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TrdnE9Q9K5 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TrdnE9Q9K5 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TrdnE9Q9K5 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TrdnE9Q9K5 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TrdnE9Q9K5 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TrdnE9Q9K5 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TrdnE9Q9K5 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TrdnE9Q9K5 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TrdnE9Q9K5 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TrdnE9Q9K5 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TrdnE9Q9K5 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TrdnE9Q9K5 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TrdnE9Q9K5 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TrdnE9Q9K5 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TrdnE9Q9K5 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TrdnE9Q9K5 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TrdnE9Q9K5 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TrdnE9Q9K5 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TrdnE9Q9K5 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TrdnE9Q9K5 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TrdnE9Q9K5 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TrdnE9Q9K5 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TrdnE9Q9K5 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TrdnE9Q9K5 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TrdnE9Q9K5 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TrdnE9Q9K5 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TrdnE9Q9K5 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TrdnE9Q9K5 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TrdnE9Q9K5 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TrdnE9Q9K5 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TrdnE9Q9K5 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TrdnE9Q9K5 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TrdnE9Q9K5 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
TrdnE9Q9K5 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TrdnE9Q9K5 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TrdnE9Q9K5 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TrdnE9Q9K5 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TrdnE9Q9K5 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TrdnE9Q9K5 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TrdnE9Q9K5 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TrdnE9Q9K5 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TrdnE9Q9K5 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TrdnE9Q9K5 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TrdnE9Q9K5 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TrdnE9Q9K5 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TrdnE9Q9K5 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TrdnE9Q9K5 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TrdnE9Q9K5 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TrdnE9Q9K5 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TrdnE9Q9K5 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TrdnE9Q9K5 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TrdnE9Q9K5 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TrdnE9Q9K5 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TrdnE9Q9K5 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TrdnE9Q9K5 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TrdnE9Q9K5 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TrdnE9Q9K5 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TrdnE9Q9K5 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TrdnE9Q9K5 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TrdnE9Q9K5 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TrdnE9Q9K5 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TrdnE9Q9K5 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TrdnE9Q9K5 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TrdnE9Q9K5 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TrdnE9Q9K5 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TrdnE9Q9K5 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TrdnE9Q9K5 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TrdnE9Q9K5 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TrdnE9Q9K5 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TrdnE9Q9K5 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TrdnE9Q9K5 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TrdnE9Q9K5 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TrdnE9Q9K5 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TrdnE9Q9K5 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms