Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9D8

Ankrd35, Ankyrin repeat domain 35, mousemouse

Predictions only

Length 996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd35E9Q9D8 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ankrd35E9Q9D8 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ankrd35E9Q9D8 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms