Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7Q1

Gm5407, Predicted gene 5407, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5407E9Q7Q1 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm5407E9Q7Q1 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm5407E9Q7Q1 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm5407E9Q7Q1 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm5407E9Q7Q1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm5407E9Q7Q1 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm5407E9Q7Q1 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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Gm5407E9Q7Q1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm5407E9Q7Q1 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm5407E9Q7Q1 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm5407E9Q7Q1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm5407E9Q7Q1 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm5407E9Q7Q1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm5407E9Q7Q1 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm5407E9Q7Q1 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm5407E9Q7Q1 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm5407E9Q7Q1 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm5407E9Q7Q1 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm5407E9Q7Q1 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm5407E9Q7Q1 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm5407E9Q7Q1 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm5407E9Q7Q1 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
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Gm5407E9Q7Q1 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm5407E9Q7Q1 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm5407E9Q7Q1 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm5407E9Q7Q1 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm5407E9Q7Q1 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm5407E9Q7Q1 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm5407E9Q7Q1 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm5407E9Q7Q1 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm5407E9Q7Q1 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm5407E9Q7Q1 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm5407E9Q7Q1 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm5407E9Q7Q1 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm5407E9Q7Q1 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm5407E9Q7Q1 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm5407E9Q7Q1 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm5407E9Q7Q1 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm5407E9Q7Q1 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm5407E9Q7Q1 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm5407E9Q7Q1 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm5407E9Q7Q1 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm5407E9Q7Q1 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
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Gm5407E9Q7Q1 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm5407E9Q7Q1 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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Gm5407E9Q7Q1 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm5407E9Q7Q1 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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Gm5407E9Q7Q1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm5407E9Q7Q1 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
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Gm5407E9Q7Q1 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Gm5407E9Q7Q1 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Gm5407E9Q7Q1 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm5407E9Q7Q1 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm5407E9Q7Q1 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm5407E9Q7Q1 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Gm5407E9Q7Q1 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm5407E9Q7Q1 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm5407E9Q7Q1 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm5407E9Q7Q1 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm5407E9Q7Q1 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm5407E9Q7Q1 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm5407E9Q7Q1 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm5407E9Q7Q1 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm5407E9Q7Q1 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm5407E9Q7Q1 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm5407E9Q7Q1 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm5407E9Q7Q1 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm5407E9Q7Q1 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm5407E9Q7Q1 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm5407E9Q7Q1 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm5407E9Q7Q1 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm5407E9Q7Q1 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm5407E9Q7Q1 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm5407E9Q7Q1 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm5407E9Q7Q1 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm5407E9Q7Q1 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm5407E9Q7Q1 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm5407E9Q7Q1 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm5407E9Q7Q1 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm5407E9Q7Q1 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
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