Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
BC005561E9Q5E2 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BC005561E9Q5E2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BC005561E9Q5E2 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
BC005561E9Q5E2 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BC005561E9Q5E2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BC005561E9Q5E2 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BC005561E9Q5E2 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BC005561E9Q5E2 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BC005561E9Q5E2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BC005561E9Q5E2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
BC005561E9Q5E2 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
BC005561E9Q5E2 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BC005561E9Q5E2 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BC005561E9Q5E2 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BC005561E9Q5E2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BC005561E9Q5E2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BC005561E9Q5E2 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BC005561E9Q5E2 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BC005561E9Q5E2 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
BC005561E9Q5E2 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BC005561E9Q5E2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BC005561E9Q5E2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BC005561E9Q5E2 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BC005561E9Q5E2 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BC005561E9Q5E2 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BC005561E9Q5E2 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BC005561E9Q5E2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BC005561E9Q5E2 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
BC005561E9Q5E2 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BC005561E9Q5E2 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BC005561E9Q5E2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BC005561E9Q5E2 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
BC005561E9Q5E2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BC005561E9Q5E2 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BC005561E9Q5E2 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BC005561E9Q5E2 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BC005561E9Q5E2 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BC005561E9Q5E2 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BC005561E9Q5E2 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BC005561E9Q5E2 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BC005561E9Q5E2 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BC005561E9Q5E2 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BC005561E9Q5E2 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
BC005561E9Q5E2 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BC005561E9Q5E2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
BC005561E9Q5E2 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BC005561E9Q5E2 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BC005561E9Q5E2 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BC005561E9Q5E2 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BC005561E9Q5E2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BC005561E9Q5E2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BC005561E9Q5E2 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BC005561E9Q5E2 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
BC005561E9Q5E2 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BC005561E9Q5E2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms