Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4S1

Pde8b, High affinity cAMP-specific and IBMX-insensitive 3',5'-cyclic phosphodiesterase 8B, mousemouse

Predictions only

Length 865 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde8bE9Q4S1 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pde8bE9Q4S1 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Pde8bE9Q4S1 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pde8bE9Q4S1 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pde8bE9Q4S1 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Pde8bE9Q4S1 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pde8bE9Q4S1 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Pde8bE9Q4S1 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pde8bE9Q4S1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pde8bE9Q4S1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pde8bE9Q4S1 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pde8bE9Q4S1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Pde8bE9Q4S1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pde8bE9Q4S1 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pde8bE9Q4S1 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Pde8bE9Q4S1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pde8bE9Q4S1 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pde8bE9Q4S1 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pde8bE9Q4S1 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pde8bE9Q4S1 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pde8bE9Q4S1 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pde8bE9Q4S1 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pde8bE9Q4S1 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Pde8bE9Q4S1 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pde8bE9Q4S1 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pde8bE9Q4S1 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pde8bE9Q4S1 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pde8bE9Q4S1 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pde8bE9Q4S1 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pde8bE9Q4S1 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pde8bE9Q4S1 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pde8bE9Q4S1 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pde8bE9Q4S1 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pde8bE9Q4S1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pde8bE9Q4S1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pde8bE9Q4S1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pde8bE9Q4S1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pde8bE9Q4S1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pde8bE9Q4S1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pde8bE9Q4S1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pde8bE9Q4S1 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pde8bE9Q4S1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pde8bE9Q4S1 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pde8bE9Q4S1 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pde8bE9Q4S1 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pde8bE9Q4S1 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Pde8bE9Q4S1 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Pde8bE9Q4S1 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Pde8bE9Q4S1 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pde8bE9Q4S1 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pde8bE9Q4S1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pde8bE9Q4S1 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pde8bE9Q4S1 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Pde8bE9Q4S1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pde8bE9Q4S1 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pde8bE9Q4S1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pde8bE9Q4S1 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pde8bE9Q4S1 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pde8bE9Q4S1 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pde8bE9Q4S1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pde8bE9Q4S1 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Pde8bE9Q4S1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pde8bE9Q4S1 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pde8bE9Q4S1 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
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Pde8bE9Q4S1 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pde8bE9Q4S1 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pde8bE9Q4S1 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pde8bE9Q4S1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pde8bE9Q4S1 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pde8bE9Q4S1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pde8bE9Q4S1 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pde8bE9Q4S1 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pde8bE9Q4S1 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pde8bE9Q4S1 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pde8bE9Q4S1 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Pde8bE9Q4S1 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pde8bE9Q4S1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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Pde8bE9Q4S1 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pde8bE9Q4S1 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pde8bE9Q4S1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pde8bE9Q4S1 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Pde8bE9Q4S1 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pde8bE9Q4S1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pde8bE9Q4S1 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pde8bE9Q4S1 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pde8bE9Q4S1 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pde8bE9Q4S1 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pde8bE9Q4S1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Pde8bE9Q4S1 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pde8bE9Q4S1 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pde8bE9Q4S1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pde8bE9Q4S1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Pde8bE9Q4S1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pde8bE9Q4S1 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pde8bE9Q4S1 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pde8bE9Q4S1 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
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