Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Tarbp1E9Q368 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tarbp1E9Q368 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Tarbp1E9Q368 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tarbp1E9Q368 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tarbp1E9Q368 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tarbp1E9Q368 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tarbp1E9Q368 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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Tarbp1E9Q368 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tarbp1E9Q368 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms