Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E4

Hectd4, HECT domain E3 ubiquitin protein ligase 4, mousemouse

Predictions only

Length 4,418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hectd4E9Q2E4 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Hectd4E9Q2E4 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Hectd4E9Q2E4 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Hectd4E9Q2E4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Hectd4E9Q2E4 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Hectd4E9Q2E4 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Hectd4E9Q2E4 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Hectd4E9Q2E4 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Hectd4E9Q2E4 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Hectd4E9Q2E4 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Hectd4E9Q2E4 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Hectd4E9Q2E4 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Hectd4E9Q2E4 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Hectd4E9Q2E4 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Hectd4E9Q2E4 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Hectd4E9Q2E4 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Hectd4E9Q2E4 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Hectd4E9Q2E4 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Hectd4E9Q2E4 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Hectd4E9Q2E4 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Hectd4E9Q2E4 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Hectd4E9Q2E4 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Hectd4E9Q2E4 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Hectd4E9Q2E4 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Hectd4E9Q2E4 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Hectd4E9Q2E4 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Hectd4E9Q2E4 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Hectd4E9Q2E4 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Hectd4E9Q2E4 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Hectd4E9Q2E4 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Hectd4E9Q2E4 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Hectd4E9Q2E4 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Hectd4E9Q2E4 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Hectd4E9Q2E4 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Hectd4E9Q2E4 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Hectd4E9Q2E4 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Hectd4E9Q2E4 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Hectd4E9Q2E4 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Hectd4E9Q2E4 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Hectd4E9Q2E4 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Hectd4E9Q2E4 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Hectd4E9Q2E4 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Hectd4E9Q2E4 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Hectd4E9Q2E4 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Hectd4E9Q2E4 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Hectd4E9Q2E4 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Hectd4E9Q2E4 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Hectd4E9Q2E4 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Hectd4E9Q2E4 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Hectd4E9Q2E4 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Hectd4E9Q2E4 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Hectd4E9Q2E4 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Hectd4E9Q2E4 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Hectd4E9Q2E4 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Hectd4E9Q2E4 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Hectd4E9Q2E4 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Hectd4E9Q2E4 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Hectd4E9Q2E4 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Hectd4E9Q2E4 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Hectd4E9Q2E4 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Hectd4E9Q2E4 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Hectd4E9Q2E4 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Hectd4E9Q2E4 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Hectd4E9Q2E4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Hectd4E9Q2E4 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Hectd4E9Q2E4 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Hectd4E9Q2E4 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Hectd4E9Q2E4 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Hectd4E9Q2E4 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Hectd4E9Q2E4 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Hectd4E9Q2E4 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Hectd4E9Q2E4 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Hectd4E9Q2E4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Hectd4E9Q2E4 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Hectd4E9Q2E4 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Hectd4E9Q2E4 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Hectd4E9Q2E4 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Hectd4E9Q2E4 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Hectd4E9Q2E4 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Hectd4E9Q2E4 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Hectd4E9Q2E4 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Hectd4E9Q2E4 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Hectd4E9Q2E4 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Hectd4E9Q2E4 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Hectd4E9Q2E4 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Hectd4E9Q2E4 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Hectd4E9Q2E4 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Hectd4E9Q2E4 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Hectd4E9Q2E4 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Hectd4E9Q2E4 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Hectd4E9Q2E4 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Hectd4E9Q2E4 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Hectd4E9Q2E4 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Hectd4E9Q2E4 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Hectd4E9Q2E4 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Hectd4E9Q2E4 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Hectd4E9Q2E4 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Hectd4E9Q2E4 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Hectd4E9Q2E4 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Hectd4E9Q2E4 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms